Ufficiale capace ed efficiente, Benjamin Sisko subì in gioventù un grave incidente: ti trovava a bordo della U.S.S. Saratoga con la sua famiglia quando i Borg sferrarono l'attacco a Wolf 359. Sua moglie morì e Benjamin riuscì a malapena a portare in salvo il figlio Jake, prima che la nave venisse completamente distrutta. Profondamente segnato dall'esperienza, Sisko ha molto faticato a trovar pace. Inizialmente anche l'assegnazione come amministratore federale alla stazione Deep Space Nine gli è passata come una condanna. Durante il suo insediamento, Sisko è però entrato in contatto con un insolito gruppo di forme di vita incorporee che abitano in un tunnel spaziale stabile, probabilmente di natura artificiale. Il contatto con questi alieni ha dato a Sisko una nuova consapevolezza della propria vita e della propria carriera, portandolo ad acquistare al tempo stesso un ruolo denso di sacrilità per il popolo di Bajor. Il tunnel spaziale è infatti, per i Bajoriani, Il tempio Celeste dove risiedono i Profeti, i quali avrebbero scelto proprio Sisko come loro emissario. Cercando di smussare i molti problemi presenti su Deep Space Nine, Sisko ha favorito la pace tra Cardassia e Bajor, nemici di vecchia data, e di recente, con l'aiuto dei suoi ufficiali, ha respinto la minaccia del terribile Dominio proveniente da Quadrante Gamma.