L'anno è il 2371 e il potere del Dominio, sostenuto dalle forze minacicose dei Jem'Hadar continua a mostrare la sua potenza mentre tutte le forze che avnzano dal Quadrante Alfa vengono respinte.

Mentre le mosse sullo scacchiere galattico continuano lentamente, a bordo della stazione Deep Space Nine i giocatori chiave hanno dei problemi più immediati:

• Quark deve affrettare l'impegno di far tornare la cupidigia nella mente del Grande Nagus ferengi, diventa capo di una casata klingon, cerca di persuadere suo nipote a non unirsi alla Flotta Stellare, e tenta di sgridare sua madre: una femmina che insiste a voler guadagnare profitti e a indossare vestiti.
• L'eredità trill di Jadzia Dax minaccia dapprima la sua vita, poi le sua amicizie, quando - una dopo l'altra - le personalità dei passati ospiti di DAx tornano ad ossessionarla.
• Kira scopre che una volta è stat Cardassiana, poi si riunisce al capo della sua vecchia cellula di resistenza ed infine imbraccia le armi contro la sua stessa gente.
• Benjamin Sisko viaggia nel tempo per assumere un ruolo che significherà mandare intenzionalmente a morte centinai di innocenti umani.

Mentre gli ufficiali della Flotta Stellare sono impegnati nei problemi di tutti i giorni, Cardassiani e Romulani non hanno successo nell'inserirsi direttamente nel conflitto, le forze del Dominio stanno lentamente seguendo una strategia che poterbbe modificare per sempre l'equilibrio di potere della galassia.